1. Bioloģijas zinātnes: mikroskopus plaši izmanto ar bioloģiju saistītās jomās, piemēram, mikrobioloģijā, zooloģijā, botānikā un ģenētikā. Tie palīdz zinātniekiem un pētniekiem novērot mikroorganismus, pētīt šūnu struktūras, analizēt audus un veikt ģenētiskos pētījumus.
2. Medicīna un veselības aprūpe. Mikroskopiem ir izšķiroša nozīme medicīniskajā diagnostikā, patoloģijā un klīniskajā izpētē. Tie palīdz pārbaudīt šūnas, audus un ķermeņa šķidrumus, ļaujot ārstiem noteikt precīzu diagnozi un izstrādāt atbilstošus ārstēšanas plānus.
3. Materiālzinātne un inženierija. Mikroskopi ir ļoti svarīgi materiālu analīzei tādās nozarēs kā metalurģija, polimēri, nanotehnoloģijas un pusvadītāju ražošana. Tie ļauj inženieriem un pētniekiem izpētīt materiālu struktūru, sastāvu un īpašības mikroskopiskā līmenī.
4. Kriminālistika: kriminālistikas zinātnieki izmanto mikroskopus, lai analizētu nozieguma vietās atrastos pierādījumus. Viņi var pārbaudīt pēdas pierādījumus, piemēram, šķiedras, matiņus, pirkstu nospiedumus un instrumentu zīmes, palīdzot saistīt aizdomās turamās personas ar noziegumiem vai identificēt vainīgos.
5. Elektronikas un pusvadītāju rūpniecība: mikroskopus izmanto elektronisko komponentu un pusvadītāju ražošanā, testēšanā un kvalitātes kontrolē. Tie ļauj inženieriem pārbaudīt shēmas plates, analizēt lodēšanas savienojumus un pārbaudīt, vai integrālajās shēmās nav defektu vai nepilnību.
6. Vides zinātne. Mikroskopus izmanto vides pētījumos, lai pētītu augsnes sastāvu, novērtētu ūdens kvalitāti, analizētu gaisa daļiņas un identificētu dažādās ekosistēmās esošos mikroorganismus. Tie palīdz izprast vides izmaiņas, piesārņojuma ietekmi un bioloģisko daudzveidību.
7. Izglītība un pētniecība: mikroskopus plaši izmanto izglītības iestādēs bioloģijas, ķīmijas, fizikas un citu zinātņu mācīšanai. Tie ļauj skolēniem izpētīt un vizualizēt mikroskopiskas struktūras un parādības, veicinot zinātnisko zinātkāri un uzlabojot mācību pieredzi.
8. Kvalitātes kontrole un nodrošināšana. Dažādas nozares izmanto mikroskopus kvalitātes kontroles un nodrošināšanas nolūkos. Tie palīdz atklāt defektus, izmērīt izmērus un novērtēt produktu vispārējo kvalitāti tādās nozarēs kā automobiļu rūpniecība, kosmosa rūpniecība, kosmētika un tekstilizstrādājumi.